Antallet af stillingskategorier på universiteterne er med den nye stillingsstruktur blevet reduceret. Stillingerne forskningsassistent og amanuensis slås sammen til »videnskabelig assistent« ligesom forskningsstipendiat og ph.d. slås sammen til en stillingskategori.
Det eksterne lektorat kan nu være tidsubegrænset, og det skal fortsat fortrinsvis bruges til at ansætte personer med praksiserfaring.
De, som var ansat på en sektorforskningsinstitution før 1. januar 2007 fortsætter med at kunne avancere efter stillingsstrukturen, der gælder for sektorforskningsområdet og alle nyansatte på universiteterne ansættes i henhold til den nye stillingsstruktur for universitetsansatte.
Der vil altså være en overgangsfase, hvor nogle universitetsansatte kan avancere efter stillingsstrukturen, der gælder for sektorforskningsinstitutionerne, nogle er omfattet af den nye stillingsstruktur på universitetsområdet og de som fortsat er ansat på en ren sektorforskningsinstitutioner er omfattet af stillingsstrukturen, der gælder for sektorforskningsinstitutionerne.